击败红莲道馆馆主夏伯后即可开启七之岛群的前段路线，离开道馆时与比尔对话并答应同行，会直接乘船抵达一之岛；如果当时拒绝，可之后在红莲岛宝可梦中心找比尔再次出发。抵达一之岛后，进入宝可梦网络中心与celio对话，获得三岛通行证，随后可从码头乘坐海烈号前往一之岛、二之岛和三之岛。三岛通行证只负责前三座岛，不能直接前往四至七之岛。
完成一至三之岛的主线任务是继续解锁后续区域的必要步骤，推荐按二之岛交付陨石—三之岛击退暴走族—前往浆果森林救回Lostelle—返回二之岛交任务—回一之岛找Bill和Celio的顺序推进。三之岛的暴走族挡路时必须先击败他们，浆果森林深处还要与催眠貘战斗后才能救出女孩。完成这段流程后，可以正常从枯叶市港口往返关都与前三座岛；如果已经通关再开始七岛剧情，也要先补完这条救援任务线。
四至七之岛需要同时满足击败四天王、捕获图鉴中至少60种宝可梦、获得全国图鉴三个条件。通关后检查宝可梦图鉴，若已记录至少60种捕获数据，就回到真新镇大木博士处升级全国图鉴；随后从枯叶市港口乘船前往一之岛，在宝可梦网络中心与Celio对话。前往灯火山东侧，击败堵住洞口的两名火箭队成员，进入山洞后使用怪力推动岩石，在深处取得红宝石，再返回一之岛交给Celio，即可获得彩虹通行证。缺少全国图鉴时，灯火山洞口的火箭队不会让开；只打赢四天王或只捕获60种宝可梦，都不足以单独解锁四至七之岛。
拿到彩虹通行证后，回到枯叶市港口与船员对话，就能选择四之岛、五之岛、六之岛或七之岛，四座岛不需要按固定顺序登船。若要继续完成Celio的联络机器任务，建议先去四之岛的冰瀑洞窟取得登瀑术，并击退洞内火箭队；之后到六之岛遗迹谷，用居合斩进入点之穴触发蓝宝石事件，再根据获得的密码进入五之岛火箭队仓库，夺回蓝宝石并交还Celio。七之岛在获得彩虹通行证后即可直接抵达，不必先完成蓝宝石流程，但岛上的部分道路和隐藏区域仍需要冲浪、怪力或碎岩等秘传技。
出生岛和肚脐岩不属于普通剧情中的七座岛，彩虹通行证不能直接开启这两个地点。前往出生岛需要极光船票，前往肚脐岩需要神秘船票，这些票券属于特殊活动或配信道具；没有对应票券时，即使已经通关、取得全国图鉴并完成红宝石与蓝宝石任务，也只能正常往返一之岛至七之岛。
